Dentro da Bujinkan, são nove as escolas que a compõem. A explicação que Hatsumi Sensei dá é a seguinte: “Cada uma das escolas que praticamos se especializam em distintas áreas de combate. Praticamos nove, porque uma seria limitada, e veríamos as coisas de um só lado, o qual nos converteria em guerreiros incompletos”.

A ordem em que estão postas as escolas, é a ordem de Antiguidade de cada uma. O estilo Togakure é o mais antigo e do qual se acrescentou e uniu com o tempo à prática de outras escolas, incluindo escolas samurais, como o estilo Kukishinden Ryu.

Hoje em dia é muito difícil ver alguma prática de alguns dos estilos de ninpoh nos dojos do Japão. São reservados e escondidos, e raramente alguém consegue tomar contato com eles. As práticas de dojo se limitam ao taijutsu que inclui jutai, dakentai e koppo. Antigamente se praticava nos dojos os estilos de ninpoh com muito mais frequência e por isto se tornou a base de muitas técnicas da Bujinkan.

O ninpoh ou ninjutsu, “técnica de resistência”, abrange áreas muito variadas entre as quais está a estratégia de guerra, supervivência, a psicologia, e todas aquelas ramificações que contém a arte da guerra. O combate noturno, a meditação, a mimetização, o uso dos elementos são só partes do ninpoh, partes que ainda não se deixam ver bem, mas que são por sua vez as partes mais ricas e essenciais do ninjutsu.